Funkcionalna klasifikacija se uporablja pri:

• analiziranju in prikazovanju tokov porabe javnofinančnih sredstev po funkcionalnih namenih izdatkov neposrednih in posrednih uporabnikov,
• pripravi predloga državnega in občinskih proračunov ter finančnih načrtov neposrednih uporabnikov
• in pripravi predlogov finančnih načrtov Zavoda za pokojninsko in invalidsko zavarovanje Slovenije, Zavoda za zdravstveno zavarovanje Slovenije in ostalih javnih skladov, katerih ustanovitelj je država ali občine.