Upravljavec sredstev sistema EZR deponira denarna sredstva EZR države v obliki depozitov pri bankah oziroma pri hranilnicah, ki imajo dovoljenje Banke Slovenije za opravljanje bančnih storitev v skladu z zakonom, ki ureja bančništvo, pri Banki Slovenije ter pri državnih zakladnicah držav evropske monetarne unije.